Improvement of the reverse transcription loop mediated isothermal amplification (RTLAMP) method for the detection of <i>Peach latent mosaic viroid </i>(PLMVd)
Abstract
Peach latent mosaic viroid (PLMVd) is the most known peach viroid. Among the diagnostic techniques used for its detection, the most recent described being the reverse transcription loop-mediated isothermal amplification method (RT-LAMP). Several modifications were done on the basic protocol proposed by Boubourakas et al. (2009), additional experiments were preformed in order to further evaluate the method. Namely, the reaction time was further reduced and traces of leaf tissue, taken by a sterile toothpick, instead of tRNA were used as the intial material. Moreover, the AMV reverse transcriptase proved to be more effective than Thermoscript, while restriction enzyme analysis was performed on the RT-LAMP products in order to confirm that products had the respective sequences of the selected target. Finally, the extremely high efficiency and sensitivity of RT-LAMP proved to be sufficient for the detection of PLMVd in hosts other than peach.Keywords: PLMVd, RT-LAMP, peach, reverse transcriptases
Downloads
Veröffentlicht
2010-09-28
Ausgabe
Rubrik
Artikel
Lizenz
Dieses Werk ist lizenziert unter einer Creative Commons Namensnennung 4.0 International Lizenz.
Sie dürfen:
- Teilen — das Material in jedwedem Format oder Medium vervielfältigen und weiterverbreiten
- Bearbeiten — das Material remixen, verändern und darauf aufbauen und zwar für beliebige Zwecke
Unter folgenden Bedingungen:
-
Namensnennung — Sie müssen die Namen der Autoren und den Titel des Werkes angeben, einen Link zur Lizenz beifügen und anmerken, ob Änderungen vorgenommen wurden.
- Keine weiteren Einschränkungen — Sie dürfen keine zusätzlichen Klauseln oder technische Verfahren einsetzen, die anderen rechtlich irgendetwas untersagen, was die Lizenz erlaubt.